Hovedforskjellen er forskjellen i det aktive materialet. Det aktive materialet til sekundærbatteriet er reversibelt, mens det aktive materialet i primærbatteriet ikke er reversibelt. Selvutladingen til primærbatteriet er mye mindre enn sekundærbatteriets, men den interne motstanden er mye større enn sekundærbatteriets, så belastningskapasiteten er lavere.
I tillegg er den massespesifikke kapasiteten og volumspesifikke kapasiteten til primærbatteriet større enn vanlige oppladbare batterier.
